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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

鹤岗铁路正式通车！“绿巨人”首次驶入黑龙江******url:https://m.gmw.cn/2022-12/26/content_1303235135.htm,id:1303235135

　　12月26日8时34分，随着首趟“复兴号”动力集中型动车组从鹤岗站平稳驶出，标志着鹤岗铁路正式通车。黑龙江省东部铁路网进一步完善，人民群众出行更加方便快捷。

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　　佳鹤间最快44分钟可达

　　鹤岗至哈尔滨最快3小时33分钟

　　据了解，鹤岗铁路位于黑龙江省东北部地区，线路南起佳木斯市，北至鹤岗市，全长71.5公里，其中莲江口至大陆段设计时速160公里，鹤立至大陆段设计预留时速200公里条件。全线设佳木斯、莲江口、鹤立、鹤岗4座客运车站，其中佳木斯、鹤立、鹤岗站具备接发动车组条件。开通后，鹤岗至佳木斯最快44分钟可达，鹤岗至哈尔滨最快3小时33分钟可达。

　　据介绍，鹤岗铁路开通初期将安排开行鹤岗至哈尔滨、鹤岗至佳木斯等方向动车组列车5对，后期将根据客流变化和车体安排，按照日常线、周末线安排列车开行，单日开行动车组可达8.5对。

　　哈尔滨局集团公司进一步优化鹤岗铁路中转换乘列车运行时刻和车站股道安排，鹤岗铁路经佳木斯、哈尔滨等站可与北京、大连、西宁、石家庄、牡丹江等方向运行的部分列车实现同站台换乘，中转换乘列车接续时间最短间隔10分钟左右，方便旅客出行。运营初期，铁路部门进一步扩大票价优惠范围和幅度，鹤岗铁路日常线全部列车将执行折扣优惠政策，折扣幅度分区段为5.5—9折，让旅客共享铁路发展红利。

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　　“绿巨人”动车组列车首次驶入我省

　　据介绍，此次鹤岗铁路配属的“复兴号”动力集中型动车组，被俗称为“绿巨人”，系首次驶入我省，最高运行时速160公里，其平面布置、内部装饰、人机界面等方面参照“复兴号”动车组进行优化设计，车身为国槐绿涂装，采用流线型外形，将更好地满足旅客便捷性、舒适性需求，这也是“绿巨人”目前到达的我国最北端高寒地区。

　　鹤岗铁路开通运营后，将进一步完善东北地区路网结构，极大便利沿线人民群众出行，对于促进沿线资源型城市转型发展，推动新时代东北全面振兴具有十分重要的意义。

　　转自：“黑龙江日报”微信公众号

　　图片均由铁路部门提供

　　记者：栾德谦

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）